Das dürfte aus mehreren Gründen schwierig werden. Eine zuverlässige Erkennung geht nur, wenn Dein Gegenüber tatsächlich die "Antworten"-Funktion verwendet, da nur dann der passende Message-Key verwendet wird. Außerdem müssten die Antworten vermutlich jeweils im selben Ordner landen wie Deine Ursprungs-Mail - wobei man das per (aufwändigerem) Index / Datenbank innerhalb Thunderbirds bestimmt auch über alle Ordner hinweg realisieren könnte. Ich glaube aber nicht, dass es bisher möglich ist.
Da hilft (vermute ich) nur ein Ordnungssystem, dass Du selbst "verwaltest".