Hallo Dennis,
oft liegt das an Sicherheitssoftware (Virenscanner...), der das Profil zu scannen nicht verboten wurde.
Ich vermute, dass die Datei popstate.dat dabei geschädigt wurde, weshalb TB halt alle Mails vom Server erneut lädt. Dies führt dann wiederum dazu, dass auch die Mails für die Suche neu indiziert werden, wenn das in den Einstellungen nicht geändert wurde.