Hallo und willkommen im Forum.
bevor ich dir antworten, poste mal, ob du separate oder globale Konten hast.
Oder siehst du links im Ordnerfenster nur die lokalen Ordner mit Unterordner oder auch "Konto-Ordner?
Normalerweise antwortet TB mit der Mailadresse (oder dem Konto), an die die Mail versendet wurde.
Lässt du aber die Mails in andere Ordner (außer dem lokalen) filtern oder verschiebst/kopierst diese, nimmt TB das Konto, in dessen Ordner sich die Mail gerade befindet.
Probiere das am Besten mal mit unwichtigen Mails selbst aus.
Bei mehreren Identitäten und im oben geschilderten Fall nimmst du am besten das Add-on Correct Identity
Das von Joke verlinkte.Add-on ist leider nicht mehr kompatibel.
Gruß