Ja, da tauchen die Nachrichten in der Tat auf :).
Durch Probieren habe ich zufällig gerade herausgefunden, dass der "gruppiert"-Flag (nenn ich jetzt mal so) verschwindet, wenn ich die Nachrichten aus TB2 exportiere und in TB3 importiere. Nun kann ich sie wie gewünscht verschieben.
Interessanterweise habe ich seitdem keine Probleme mehr mit dem Versenden und es wird jedes Mal brav eine Kopie im "Gesendet"-Ordner des jeweiligen Kontos gespeichert. Als wäre der Knoten geplatzt und man müsste TB nur mal richtig tadeln.