Hallo Dan007 und willkommen im Thunderbird-Forum,
wenn ich Dich richtig verstanden habe, so hast Du eine Sicherung der Inbox (Posteingang) gemacht, die aber natürlich sofort mit dem Server abgeglichen wird und die Mail wieder löscht.
Also stelle TB so ein, dass er im Offline-Modus startet, schließe ihn und kopiere die Inbox wieder ins Profil. Dann starte TB im Offline-Modus (Du kannst natürlich auch die Internetverbindung kappen) und kopiere die entsprechende Mail in den Lokalen Ordner. Dann in den Online-Modus wechseln und Du kannst nun die Mail aus dem Lokalen Ordner wieder zurück auf den Server (in den Posteingang des Mail-Kontos) kopieren.
Gruß
slengfe