So, nun hab ich auch noch folgendes ausprobiert:
lösche den Ordner in C:\Dokumente und Einstellungen\%Benutzername%\Lokale Einstellungen\Anwendungsdaten\Thunderbird
(Achtung, auch der ist versteckt)
Da finde ich nur Mozilla\Firefox oder Mozilla\Extensions.
Also ist da anscheinend schon was gelöscht?