Hallo, ich hatte das gleiche "Problem". 
Lösung: Im Windows Explorer einen Ordner öffen. Den Inhalt nach Namen sortieren.
Unter Extras Ordneroptionen Ansicht "Für alle übernehmen" .
Danach sind die Dateianhänge die man unter Thunderbird einfügen will wieder namentlich sortiert.
WinXP
Thunderbird 3.0.5