Hallo,
bisher kenne ich keinen Anbieter (leider nennest du deinen nicht, zudem fehlen noch andere Infos), der den Ordner "Junk" nennt. Daher handelt es sich es wohl nicht der vom Server vorgefilterte Ordner.
Daher vermute ich, dass du in deinen Einstellungen in Thunderbird (oder evtl. sogar serverseitig?) festgelegt hast, dass Junk in diesen Ordner verschoben werden soll. Deshalb erstellt Thunderbird diesen Ordner nach Bedarf immer wieder neu.