Vielleicht noch ein Nachtrag.
Das zweite Profil hat das gleiche Popup (kein Email Client zugeordnet), exisiterte aber noch nicht unter Linux. Hier kann ich die oben genannten Einstellunge zu einem individuellen Pfad für den Benachrichtigungsklang setzen.
Hier ist unter Systemintegration auch ein Haken bei "Beim Starten prüfen, ob Thunderbird als Standard-Anwendung registiert ist" gesetzt. Das Problem scheint also unabhängig davon zu sein?!