Danke für eure Unterstützung. Ich weiß nicht wieso, aber es scheint nun mit der neuen Version des Thunderbird (38.3.0) wieder mit der Anwendung zu laufen. Wobei ich das Problem habe, das ich den Grund nicht nachvollziehen kann, da der Header noch immer in dieser Schreibweise übermittel wird. Ich habe in den Release notes keinen direkten Hinweis gefunden ob es noch an einem weiteren Fehler gelegen haben kann. Zumindest kann meine Anwendung mit den Headern und Mails wieder etwas anfangen.
Das Thema ist für mich erstmal erledigt. Danke nochmal.