Hallo,
zeig mal einen anonymisierten Screenshot, so dass man die Symbole der fraglichen Ordner zusammen sehen kann. Meint die Darstellung in Thunderbird.
Weiter kannst Du schon mal über Rechts-Klick / Eigenschaften jeweils schauen, ob das nicht vielleicht doch unterschiedliche IMAP-Ordner sind, die lediglich in Thunderbird den gleichen Namen haben.
Gruß
Sehvornix