Ich habe auch das Problem des "Verschwindens" von E-Mails aus dem Posteingang gehabt, nachdem ich das neueste TB -Update ( auf 52.2.1 32-Bit) gemacht hatte
Den Grund habe ich nicht herausgefunden, aber eine (relativ einfache) Möglichkeit) gefunden, das Problem zu bereinigen. Ich hatte eine Sicherung des früheren Dateien gemacht (einmal wöchentlich) und konnte die "alten Mails" in den aktuellen Posteingang zurückholen. Das ging schnell und Zuverlässig mit dem aktuellen ImportExportTools-3-2-5.xpi, das hier herunterzuladen ist.
Aber das ist ja schon von Dir selbst gefunden worden.
Beste Grüße
dido