Eine unterschiedliche Färbung des Hintergrunds habe ich überhaupt nicht, siehe mein Screenshot.
Nachtrag: Ah, das ist eine optionale Einstellung. Standardmäßig ist das nicht der Fall, aber man kann das in den Anzeige-Einstellungen aktivieren.
Einen „Rückschritt“ kann ich bei dir jedenfalls nicht erkennen. Im Gegenteil ist die Färbung in deinen Screenshots bei Thunderbird 11.1 meiner Ansicht nach besser als bei Thunderbird 11.0, denn logisch betrachtet würde man eher die bereits gelesenen E-Mails „blasser“ darstellen als die ungelesenen.
Aber so oder so ist der Unterschied zwischen gelesen und ungelesen bei dir deutlich erkennbar. Das Problem des Themenstarters war es ja nach eigener Angabe, das fast gar nicht unterscheiden zu können. Und das sollte jetzt in jedem Fall besser sein.