Hallo
und willkommen im Thunderbird-Forum!
Richte doch mal mit Datei>Neu>Virtueller Ordner einen solchen ein und wähle alle gewünschten Ordner aus (markiere den ersten Ordner, dann den Letzten mit gedrückter Shift-Taste , schon sind alle markiert und dann die Leertaste drücken) und keine Bedingungen und fertigstellen.
Dann den vO anklicken und du erhältst eine virtuelle Ansicht mit allen Mails und mit Strg a und dann der Taste m oder Rechtsklick>Markieren>Gelesen