Hallo Thunderbirdfreund,
und willkommen im Thunderbird-Forum!
Ich kenne das Problem nur mit dem Hintergrund, dass TB scheinbar beendet aber doch noch am Laufen ist (löscht noch die Mails auf den POP Konten, gleicht noch ab, hängt irgendwo weil z.B. der Virenscanner ausgehende Mails noch scannt) oder der Mail-Server die Verbindung noch offengehalten hat und deshalb kein PW abfragt.
das hat, wie Peter_Lehmann ja bschrieben hat, nichts mit dem Masterpw. zu tun!