guten Abend!
Der Posteingang sollte immer möglichst leer sein. Aber weg sind die Mails nicht, sie sind also im Ordner, in den Du verschieben wolltest, nicht angekommen.
Schließe thunderbird und kopiere aus dem Verzeichnis c:\users\username\appdata\roaming\thunderbird\profiles\langezahlenbuchstabenkombination\mail\kontoname den Folder Inbox alsodie MBX-Datei Inbox ohne Endung irgendwoanders hin. Wenn du ganz sicher gehen willst, dass nichts schiefgeht, dann kopiere den ganzen Ordner Thunderbird auf eine externe Partition oder anderen Datenträger.
Öffne dann Thunderbird - bzw. lade dir die Erweiterung
RecoverDeletedMessages
herunter und installiere sie dann in Thunderbird. Versuche damit, Deine Mails aus der Inbox wieder herzustellen, hoffentlich sind es nicht schon so viele, dass Du Probleme hast.
Dann müsstest Du nämlich die Datei Inbox per Hand mit einem Editor, der große Textmengen verträgt, editieren.
Sollten Deine Mails ordnungsgemäß dann verschoben sein, komprimiere unbedingt den Posteingang, bzw. am besten das gesamte Konto.
Denn wenn Du Mails löscht, auch durch Verschieben, werden diese nur als gelöscht markiert, bleiben aber physisch vorhanden, erst durchs Komprimieren sind sie endgültig weg.