Eigentlich geht es um gesendete und empfangende Nachrichten von einem E-Mail-Postfach.
Das wären doch schon mal zwei verschiedene betroffene Ordner ... mindestens:
Lagen die vermissten Mails alle noch im Posteingang bzw. in 'Gesendete Mails' / 'Gesendet'?
Was heißt "separate Ordner"?
Zum Beispiel selbst angelegte Unterordner, in welche du die Mails der betroffene Jahrgänge verschoben hattest.
Je nach Antwort wären nämlich nur die betroffenen Ordner zu identifizieren und aus der Sicherung in das aktuelle Profil zu kopieren. Aber welche und wohin, hängt davon ab, wo exakt die Mails vermisst werden.