wenn ich in Thunderbird Mails lösche, werden sie automatisch auf dem Server ebenfalls gelöscht.
... bzw. ich verstehe es nicht,
Bei IMAP zeigt der Mailclient (hier also Thunderbird, aber bei anderen verhält es sich ebenso) stets den Stand auf dem Mailserver an.
Wenn du im Mailclient (Thunderbird) eine Mail löscht, so ist dies ein Befehl an den Mailserver, die Mail zu löschen. Auf dem Server wird nun die Mail gelöscht und der Mailclient zeigt die neue Sitation an.
Das von dir beschriebene Verhalten ist für/bei IMAP ausdrücklich so vorgesehen, somit also korrekt.