Ein Verzeichnis dessen Mail nicht angezeigt werden
Das ist in der Tat sehr merkwürdig und lässt an eine Korruption einiger Mailbox-Dateien denken. Ich habe kürzlich bei einer Fernwartung ein ähnliches Problem gesehen.
Ich schlage dir folgenden Test vor: bei beendetem TB kopiere die 2 GB große Mailbox-Datei "Alex & Friends all others" und füge sie direkt in Local Folders ein, also nicht in einen der *.sbd Ordner. Öffne sie mit Text-Edit und überprüfe mittels der Suchfunktion von Text-Edit, ob mehrere (oder vielleicht alle?) der darin enthalten Nachrichten den X-Mozilla-Status 0009 haben.
Benenne die Datei "Alex & Friends all others" um in "Test" und starte TB wieder. Überprüfe ob der Ordner "Test" jetzt immer noch keine Nachrichten enthält. Falls ja versuche ihn über "Eigenschaften zu reparieren. Wenn auch das nicht funktioniert, installiere das Add-on "Undelete" von ggbsde und versuche, die gelöschten Nachrichten wiederherzustellen.