Du kannst noch einen weiteren Versuch machen, indem du bei beendetem TB die Datei "localstore.rdf" aus dem Profil verschiebst.
Beim nächsten TB-Start wird die Datei neu erstellt, und deine persönlichen Einstellungen für Fenstergrößen, Ansicht, Symbolleisten, ... werden durch die Standard-Einstellungen ersetzt.
Wähle jetzt die Favoriten-Ansicht, beende TB, starte erneut und überprüfe die Ansicht.
Wenn TB jetzt wieder automatisch "Alle" Ordner anzeigt, kannst du die zuvor verschobene Datei localstore.rdf" wieder ins Profil einfügen, damit du wenigstens deine persönlichen Einstellungen wieder hast.
Wenn auch dieser Test keinen Erfolg bringt, kann es m. E. nur an einem Add-on liegen.
Du solltest dann nochmals testen, indem du im Add-ons Manager alle Erweiterungen und Dritt-Themen manuell deaktivierst.
Du kannst auch eine Liste deiner Add-ons einstellen (Hilfe -> Infos zur Fehlerbehebung -> Erweiterungen).