Hallo,
du hast die Erweiterung "Thunderbird Conversations" in deinem Thunderbird installiert. Und diese Erweiterung bewirkt nun mal, dass sich beim Doppelklick auf eine Nachricht das in deinem oberen Screenshot gezeigte neue Fenster öffnet.
Ich benutze diese Erweiterung nicht, kann dir deshalb auch nicht sagen, ob sich das ändern lässt. Vielleicht schaust du dir mal die Einstellungen für diese Erweiterung an. Natürlich gibt es auch eine radikale Lösung, aber die findest du sicher selber....