Danke für Deine schnelle Rückmeldung!
Ich hab natürlich alles Mögliche ausprobiert, aber nicht an die Add-ons gedacht, weil die bei mir bislang nie wirklich Probleme gemacht haben. Hab es mal so ausprobiert wie Du es beschrieben hast und ohne "Thunderbird Conversations 2.8.1" läuft es wieder wie gewohnt. Danke!
Die zwei lokalen Ordner kommen wohl über Quick Folders, der eine ist für den Posteingang, der andere die "Nachrichtenablage".