Hallo,
wenn noch nicht geschehen, dann auf jeden Fall sofort ein Backup des Ordners 'Thunderbird' unter ..\roaming\.. vornehmen (%appdata%, falls der Speicherort nicht individuell verdreht wurde). Hoffentlich wurde noch nicht repariert oder komprimiert.
Wo genau und was genau liest Du mit dem Editor aus?
Ein Ordner in Thunderbird wird auf Dateiebene durch eine endungslose Datei repräsentiert. Hat dieser Ordner in Thunderbird Unterordner, so gibt es dazu eine Datei, endungslos, mit dem Namen dieses Unterordners und ein Verzeichnis mit dem Namen des Unterordners + Endung .sdb. Das Schema wiederholt sich entsprechend für weitere Unterebenen. Wenn der Aufbau nicht so vorhanden ist, werden Unterordner nicht angezeigt.
Eine Mail, die zwar im Klartext in einer mbox-Datei zu finden ist, aber nicht von Thunderbird angezeigt wird, hat vielleicht einen 'X-Mozilla-Status' ungleich '0001'. Den könnte man manuell zurücksetzen auf 0001. Manuell bedeutet, editieren der mbox-Datei mit besagtem Editor.
Aber vorher sollte hier mit Unterstützung geklärt werden, wie der aktuelle Status ist.
Gruß
Sehvornix