Hallo Hendrik,
willkommen im Thunderbird-Mail-Forum.
Sicher, dass die zu beobachtende Aktion durch den obersten Filter erfolgt? Am besten mal die Filterprotokollierung aktivieren (müsste ja bereits laut Deiner Beschreibung). Evtl. ist es ja doch einer der anderen Filter. Die Markierung '[x] Aktiv' sorgt wohl dafür, dass der Filter automatisch beim Abruf oder beim Versand (und auch bei Archivierung) ausgeführt werden und eben nur auf den Posteingang und auf Gesendet.
[ ] werden nicht automatisch ausgeführt, können aber weiterhin manuell auf Ordner angewendet werden. So ist das jedenfalls hier in meinem Thunderbird. Allerdings ein 128.9.2esr. Es wäre nicht total abwegig, dass auch hier ein Problem mit der Release-Version 137 besteht.
Ansonsten müsstest Du wohl die Filter und Beispiele wenn möglich dokumentieren. Natürlich anonymisiert.
Gruß
Sehvornix