Stimmen in den IMAP einstellungen auch Server und Benutzername überein? Vermutlich ja, da sie den selben Datenbestand haben.
Dann schau in den Konteneinstellungen bei 'Server-Einstellungen' ganz unten bei 'Lokaler Ordner'. Sind dort die Pfade unterschiedlich, so handelt es sich tatsächlich um unterschiedliche Konten die aus unbekannten Gründen denselben IMAP Server verwenden. Dann kannst du eines der Konten gefahrlos löschen inkusive der Daten
Wenn jedoch die Pfade identisch sind, so wird es etwas schwieriger. Ich bin jetzt nicht ganz sicher, aber ich meine, du kanst ein Konto löschen, muß aber unbedingt vermeiden, das die lokalen Daten gelöscht werden. Kann das bitte einer der anderen Helfer verifizieren/konkretisieren?