Anhänge abgeschnitten bei IMAP und Avast Antivirus [erl.]

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Gibt es irgendwelche Timeout oder 'Chunk-Size' Einstellungen in Thunderbird die das Problem evtl. auch bei angeschaltetem Mail-Scanning beheben? Wenn ja welche?

Es gibt die zwar, ich kann dir aber nicht garantieren, ob das in deinem Fall helfen wird, da nur an Symptomen gewerkelt wird. Du müsstest das selbst testen, das ist schon eine Menge Arbeit, die richtigen Einstellungen zu finden.
Den Servertimeout zu erhöhen ist aber kein Problem:
erweiterte Konfiguration (Extras, Einstellungen, Erweitert, Allgemein, "Konfiguration bearbeiten")
den Eintrag mail.server.serverx.timeout.
"x" steht für eine Zahl entspr. der Anzahl der Konten.
Der Wert steht für "Sekunden".

chunk-size usw.:

http://kb.mozillazine.org/Entire_message…an_IMAP_message

Mein Tipp: verzichte auf jegliches Abscannen von Mails. Vor Malware in Mails kann man sich selbst gut schützen.
Ich selbst lasse meinen Virenscanner nicht auch nur in die Nähe von Mails.
Nur so gibt es auf Dauer keine Probleme mit Mails.
Man klickt niemals auf einen Anhang - auch nicht in Mails von Freunden - der nicht angekündigt wurde. Bekommst du also einen, entsorge die Mail sofort. Solange man nicht auf einen Anhang klickt, kann er auch niemals ausgeführt werden.
Und überlege dir, anstatt HTML-Mails nicht besser Reintextmails anzeigen zu lassen. Hier ist die Virengefahr extrem gering und gegen null tendierend. Und bevor man einen Link anklickt, kurz in die Statusleiste schauen, ob der nicht umgeleitet wurde.

https://www.thunderbird-mail.de/wiki/Das_Mbox-…C3%BCr_Probleme
https://www.thunderbird-mail.de/wiki/Antivirus…erlust_droht%21
https://www.thunderbird-mail.de/wiki/Datenverlust_vorbeugen
http://sicher-ins-netz.info/wuermer/mailbox.html

Gruß