Thunderbird speichert Emails nicht mehr

Thunderbird-Version: 17.0.2
Betriebssystem + Version: Windows XP Professional 2002
Kontenart (POP / IMAP): POP
Postfachanbieter (z.B. GMX): GMX

Hallo zusammen,
seit dem 20.11.2012 habe ich folgendes Problem: Thunderbird speichert meine Emails nicht mehr! Allerdings nur, wenn ich den PC komplett herunterfahre, wenn ich nur Thunderbird beende, sind auch die Emails seit dem 20.11.2012 da. Auch werden Sie nur in zwei Ordnern (Posteingang und Arbeit) nicht mehr gespeichert, in den anderen Ordnern funktioniert das Speichern noch. Thunderbird lädt mir also nach jedem Neustart des PC alle Emails seit dem 20.11.2012 erneut runter.
Woran könnte es liegen? Habe bereits Thundebird deinstalliert und auch versucht, eine ältere Version zu installieren, hat beides nichts geholfen. Leider war ich zwischenzeitlich lange nicht mehr am PC, daher weiß ich leider nicht mehr, ob ich an diesem Tag evtl ein Update gemacht habe, aber ich denke, ich habe ein Backup gemacht...
Weitere Infos: Ich belasse die Nachrichten auf dem Server (Postfachanbieter GMX)

Viele Grüße,
fetate

war vielleicht etwas blöd formuliert
Reparieren der Ordner hat nichts gebracht, auch verschieben und anschließend komprimieren nicht.
Die Orden-Größen sind:
Posteingang: Anzahl Nachrichten: 2380; Größe auf Datenträger:426 MB
Arbeit: Anzahl Nachrichten: 2858; Größe auf Datenträger:865 MB
Emails werden in den Posteingangsodrner abgerufen und wurden erst dann per Filter in "Arbeit" verschoben.
Auch wenn ich jetzt Nachrichten in "Arbeit" (+Unterordner) verschiebe, sind diese nach einem PC-Neustart nicht mehr in diesen Ordnern vorhanden, sondern werden nur wieder neu in "Posteingang" geladen (ich belasse die Nachrichten auf dem Server). Alleridngs sind Nachrichten vor dem 20.1..2012, die ich von dort wegverschiebe/lösche, nach jedem PC-Neustart wieder da.
In "Posteingang" sind nach jedem PC-Neustart alle Nachrichten seit dem 20.11.2012 verschwunden und werden erneut abgerufen.
Wenn ich Nachrichten in irgendeinen anderen Ordner (außer "Arbeit"+Unterordner) verschiebe, werden diese zwar dort gespeichert, aber nach jedem PC-Neustart trotzdem erneut in den Posteingangsordner heruntergeladen.

VielenDank für die Hilfe!