ergänzend, falls sich das Problem nicht schon durch Deaktivieren von Schnellfiltern löst:
Ganz unten im Startbeitrag ist IMAP erwähnt.
So oder so dringend (Thunderbird beenden! und) den TB-Profil-Ordner (oder den ganzen TB-Anwendungsordner) sichern.
Vermutlich reicht es schon, dann in dem betroffenen Speicherpfad die zum zickenden Konto gehörende Datei inbox umzubenennen. Sollte m.E. beim nächsten Start neu erzegt werden und - wenn IMAP stimmt! - dann auch einigermaßen zügig wieder aktualisiert werden und alle Mails anzeigen.
Aber mal sehen, was noch für Hinweise kommen ....