In dem Posteingangsordner wird alles zusammen gesammelt.
Hast du für alle deine POP-Konten den "globalen Posteingang" in den Lokalen Ordnern eingerichtet?
Wenn man "Posteingang.msf" und "Posteingang" in Mail/Local Folders/Inbox kopert/verschiebt,
Im Profil gibt es normalerweise keine Dateien "Posteingang" bzw "Posteingang.msf", sondern Inbox und Inbox.msf
Wenn sich in deinem Profil eine Datei Posteingang befindet, bedeutet das, dass du in Thunderbird einen generischen Ordner Posteingang erstellt hast.
Generische Ordner lassen sich im Gegensatz zu Systemordnern natürlich löschen oder verschieben.
Mehr habe ich zu deinem sehr unklaren Problem nicht zu sagen.