Mit Linux wird das in Thunderbird zwar auch angeboten, aber es wird keine Datei gespeichert, also im ausgewählten Dateiordner ist nichts zu finden.
Unter Kubuntu (Linux) und CachyOS (Arch-Linux) ist deine Aussage nicht nachvollziehbar.
Arbeitest du mit einer Flatpak-, snap-, DEB- oder ppa-Version von Thunderbird?
Wo genau (in welchem Ordner) möchtest du denn jene *.eml-Dateien ablegen?