Ich habe die Logs bei mir nun ebenfalls aktiviert. Die Logs sehen ähnlich aus. Dass darin Enigmail auftaucht, hat offenbar nichts mit der ehemaligen Erweiterung zu tun. Man hat wohl die Bezeichnung für die Code-Teile, die nun integriert wurden, beibehalten. Daran liegt es also nicht.
Ist der für die alten Mails benötigte Schlüssel noch dein derzeit aktiv benutzter Schlüssel, also der, den du auch als externen Schlüssel im Thunderbird eingebunden hast? Oder ist das ein älterer, der nur noch in der Schlüsselverwaltung des OS zur Verfügung steht?
Grad noch was: Hast du zusätzlich auch die RNP-Log aktiviert? Sieht man darin vielleicht etwas?