Nur so ein Gedanke: Guck mal bei Deinem Windows11 in den Einstellungen/Apps/Standard-Apps ob Thunderbird hier auch als Standard-Anwendung für .eml Dateien eingetragen ist. Oben in die Leiste .eml eintragen, dann sollte TB als Anwendung erscheinen. Wenn nicht, dann eben zuordnen.
Check das mal.
Viele Grüße
Mikey