Du meinst wirklich 'Filter', also das was über das Menü Extras-> Filter erreichbar ist, oder etwa Schnellfilter o.Ä.?
Es gibt in TB, keinen Mechanismus, der Filter einfach verschwinden lässt. Filterdefinitionen liegen in einer kontenspezifischen Datei msgFilterRules.dat. Falls die von übergriffiger Software gelöscht wird, sind die Filter natürlich weg.