Hallo,
Wenn man die Sofort-Rechtschreibprüfung in den Einstellungen > Verfassen deaktiviert, muss man zunächst TB neu starten, damit die Änderung wirksam wird.
Wenn du sie trotz des Entfernen des Hakens nicht dauerhaft abschalten kannst, öffne einen einfachen TextEditor, kopiere die folgende Zeile
user_pref("mail.spellcheck.inline", false);
füge sie in das Textfeld ein und speichere die Textdatei unter dem Namen user.js
Bei beendetem Thunderbird öffne den Profilordner von TB Profilordner - Wo ist er zu finden? und verschiebe die Datei user.js in den Profilordner.
Macht aber leider keinen Unterschied.
Ich kann dein Problem absolut nicht nachvollziehen, zumal der Eintrag in der user.js nichts bewirkt.
Gehe doch mal in die Add-ons-Verwaltung und überprüfe, welche Wörterbücher installiert sind.
Mache ebenfalls einen Versuch im Fehlerbehebungsmodus Fehlerbehebungsmodus
Als letzter Test bliebe noch das Erstellen eines neuen Profils.
Dass es keine Wirkung hat, eine user.js anzulegen, ist nicht richtig. Es bewirkt, dass es sich Thunderbird nach einem Neustart nicht merkt, wenn ich die Rechtschreibung in den Einstellungen einschalte 
Der Tipp mit den Wörterbüchern war aber nicht schlecht. Ich habe jetzt die Wörterbücher (vorhanden waren Deutsch und Englisch), entfernt, damit ist die Rechtschreibüberprüfung weg
Zur Eingrenzung des "Problems" möchte ich noch erwähnen, dass ich eine andere Rechtschreibüberprüfung installiert habe (LanguageTool) und daher keine zwei Überprüfungen haben wollte.
