Hi Micha,
also, meine Training.dat (das ist nicht das Protokoll!) ist etwas über 1 MB groß. Aber ich habe ja auch durch anderweitige Hygienemaßnahmen so gut wie keinen Spam.
Die 2,6 MB sind also eine gute Größe und Beweis für entsprechendes Training.
Normalerweise ... passiert der Datei wie auch dem gesamten Profil beim Updaten nichts. Aber du weißt ja, wie das mit dem Zufall und dem Eichhörnchen so ist.
Wenn in der Datei nichts drinsteht, hat das Filter keine Signaturen und demzufolge wird nichts gefiltert.
Meine Empfehlung: Die Datei aus dem letzten Backup entnehmen und ins System kopieren 
(Oder über Einstellungen >> Junk >> Trainingsdaten löschen die eventuell zerstörte und ziemlich leere Datei entsorgenund und eben neu lernen lassen. Das führt auch zur Motivation für ein regelmäßiges Backup.)
MfG Peter
