Hm,
der Pfad bis zum Ordner, in dem die Profile liegen lautet C:\Users\DEIN BENUTZER\AppData\Roaming\Thunderbird\Profiles, wenn Du das Profil von Linux dorthin kopiert hast, musst Du das dorthin kopierte Profil noch mit dem Profile-Manager* in Tb einbinden.
*
"Hilfe → "Informationen zur Fehlerbehebung" → Profile" und dort auf "about:profiles" klicken und dort dann auf "Neues Profil anlegen" und den Dialog abarbeiten.