Trifft vielleicht Nach Update sind sämtliche Kontoeinstellungen verschwunden - keine Panik! zu?
Sein Problem kommt ja nicht von einem leeren, komplett neuen Profil.
Aus dem Bauch heraus, dürfte folgendes Thema mit dessen Lösung passen:
RE: Nach Übertragen des Profils von Win 7 auf Win 10 startet Thunderbird 68 mit leerem Fenster